Jumat, 17 Juni 2022 4:43:14 WIB

Superkomputer Plus AI Hasilkan Obat

Tiongkok

Adelia Astari

Gabungan kecerdasan buatan (Artificial Inteligence - AI) dan superkomputer, dimanfaatkan ilmuwan Tiongkok merekayasa bahan kimia jadi obat di masa depan.

Dilansir dari CGTN.com, Kamis (16/06/22), superkomputer Tianhe-2 di Provinsi Guangdong, Tiongkok, digunakan sebagai platform untuk penemuan obat. 

Sekarang, algoritma berbasis AI membuat mesin lebih pintar.

Para ilmuwan dari Universitas Sun Yat-sen dan startup AI yang berbasis di Beijing, Galixir, bersama dengan orang-orang dari Institut Teknologi Georgia dan Institut Teknologi Massachusetts, melaporkan perangkat pembelajaran mendalam yang praktis untuk memprediksi jalur biosintetik untuk produk alami (NP) atau Senyawa seperti NP di Tianhe-2.

Produk alami adalah sumber utama penemuan obat klinis. Lebih dari 60 persen obat molekul kecil yang disetujui FDA di Amerika Serikat adalah NP atau turunannya.

Lebih dari 300.000 NP telah direkam hingga saat ini, tetapi karena pengetahuan produksi yang kompleks, hanya sepersepuluh yang telah dikembangkan sebagai substrat atau produk, dengan penyaringan berbantuan komputer yang sangat dibutuhkan.

Dalam sebuah studi baru-baru ini yang diterbitkan di Nature Communications, para peneliti mempresentasikan alat yang disebut BioNavi-NP untuk mengusulkan jalur biosintetik NP dari blok bangunan sederhana secara optimal, yang tidak memerlukan aturan biokimia yang sudah diketahui.

Pertama, model prediksi bio-retrosintesis satu langkah dilatih untuk menghasilkan calon prekursor untuk NP target. Model berbasis data penuh mencapai akurasi prediksi 1,7 kali lebih tepat daripada model berbasis aturan sebelumnya, menurut penelitian.

Kemudian, sistem perencanaan rute retro-biosintesis otomatis secara efisien mengambil sampel jalur biosintetik yang masuk akal.

Studi tersebut mengungkapkan bahwa toolkit tersebut dapat berhasil mengidentifikasi jalur biosintetik untuk 90,2 persen dari 368 senyawa uji.

Selain itu, para peneliti menggabungkan alat prediksi enzim yang ada untuk menyediakan server web terbuka untuk umum yang ramah pengguna yang dapat memprediksi jalur biosintetik. Ini juga dapat menilai kelayakan biologis dari jalur tersebut berdasarkan perkiraan preferensi spesies dan enzim.

Memasukkan molekul NP apa pun yang relevan ke dalam perangkat online, seseorang dapat memperoleh beberapa cara yang diprediksi untuk mensintesisnya dalam beberapa menit.

Hasil cepat hanya dimungkinkan oleh kemampuan komputasi paralel Tianhe-2 yang kuat dan sumber daya GPU yang disesuaikan, yang membantu mempersingkat waktu pelatihan dan pengujian dari lebih dari dua minggu menjadi satu hari.

Superkomputer Tiongkok Tianhe-2 telah banyak digunakan untuk mempromosikan penelitian di bidang kesehatan dan kedokteran.

Sumber: https://bolong.id/mg/0622/superkomputer-plus-ai-hasilkan-obat

Komentar